MyoD

En biologie, MyoD est une protéine, un facteur de transcription ayant un rôle-clé dans la détermination et la différenciation des cellules musculaires striées. Il fait partie des MRF[5], les facteurs de transcription myogéniques. Son gène est le MYOD1 situé sur le chromosome 11 humain

MYOD1
Structure de la protéine MYOD1. Basé sur l'identifiant PDB 1mdy.
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 1MDY
Identifiants
Aliases	MYOD1
IDs externes	OMIM: 159970 MGI: 97275 HomoloGene: 7857 GeneCards: MYOD1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 11 humain[1] Locus 11p15.1 Début 17,719,571 bp[1] Fin 17,722,136 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 7 (souris)[2] Locus 7 B3|7 30.03 cM Début 46,025,898 bp[2] Fin 46,028,523 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans muscle triceps brachial muscle vaste latéral muscle gastrocnémien muscle deltoïde muscle tibial antérieur Jéjunum placenta tête glande exocrine bouche Fortement exprimé dans poignet muscle triceps brachial muscle sterno-cléido-mastoïdien Muscle temporal skeletal muscle tissue articulation du genou muscle long extenseur des orteils Muscle oculomoteur muscle quadriceps fémoral muscle vaste latéral Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ADN sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding protein dimerization activity DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor activity transcription factor binding liaison de chromatine RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding E-box binding liaison protéique protein heterodimerization activity liaison enzymatique transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding chromatin DNA binding ubiquitin protein ligase binding transcription coactivator activity DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific promoter-specific chromatin binding Composant cellulaire transcription regulator complex nucléoplasme myofibrille noyau cytoplasme cytosol corps nucléaire Processus biologique différenciation cellulaire myotube differentiation regulation of transcription, DNA-templated regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to starvation muscle cell fate commitment cellular response to estradiol stimulus skeletal muscle fiber adaptation muscle organ development regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome myotube cell development positive regulation of skeletal muscle fiber development negative regulation of myoblast proliferation transcription, DNA-templated développent d'un organisme multicellulaire régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN phosphorylation des protéines regulation of RNA splicing positive regulation of myoblast fusion myoblast fate determination cellular response to glucocorticoid stimulus positive regulation of myoblast differentiation skeletal muscle fiber development histone H3 acetylation myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration histone H4 acetylation skeletal muscle cell differentiation positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration régulation de l'expression des gènes striated muscle cell differentiation cellular response to oxygen levels myoblast fusion myoblast differentiation skeletal muscle tissue development positive regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II positive regulation of muscle cell differentiation cellular response to tumor necrosis factor positive regulation of snRNA transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 4654 17927 Ensembl ENSG00000129152 ENSMUSG00000009471 UniProt P15172 P10085 RefSeq (mRNA) NM_002478 NM_010866 RefSeq (protéine) NP_002469 NP_034996 Localisation (UCSC) Chr 11: 17.72 – 17.72 Mb Chr 7: 46.03 – 46.03 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
Voir/Editer Humain Voir/Editer Souris